W 73 roku c.e. napięcia między Naturals a koordynatorami nadal się utrzymują, co ostatecznie doprowadziło do kolejnej wojny między Earth Alliance a PLANT. Sven Cal Bayan jest naturalnym pilotem elitarnego oddziału EA, Phantom Pain, i bezbłędnie wykonuje różne misje antykoordynacyjne swojego oddziału. Selene McGriff jest koordynatorką badawczą w neutralnej organizacji Deep Space Survey and Development Organization (DSSD) oraz twórcą mobilnego kombinezonu GSX-401FW Stargazer do eksploracji kosmosu. Chociaż ich pochodzenie jest zupełnie inne, rozszerzająca się wojna zmusi jednak ich ścieżki do zderzenia.
