L'activité démoniaque dans le monde a considérablement augmenté en raison de l'implication et des pratiques corrompues des Illuminati. Pour lutter contre l'afflux artificiel de démons, le quartier général du Vatican décide d'organiser l'examen annuel de certification des exorcistes plus tôt que prévu, afin de permettre au plus grand nombre possible d'exorcistes de prendre le relais. Tout droit venu du Vatican, l'un des plus puissants exorcistes, Lewin « Lightning » Light, arrive à la True Cross Academy pour aider à préparer les étudiants à l'examen. La facilité et la maîtrise avec lesquelles Lewin réalise les exorcismes impressionnent rapidement Ryuuji « Bon » Suguro, qui a perdu l'ambition de poursuivre ses études, et Lewin l'accepte étonnamment comme apprenti. Alors que la situation empire, les frères jumeaux Rin et Yukio Okumura sont envoyés à la recherche de l'exorciste Shura Kirigakure, récemment disparu.
