Chuck byl zajat Nicholasem Quinnem, který chce od Sarah Intersect. Sarah s Caseym to nevzdávají a jdou Chucka zachránit. Vše se komplikuje v japonském vlaku Bullet Train, ve kterém je jak Nicholas Quinn a jeho lidé, tak Chuck a jeho přátelé. Sarah se Chuckovi svěří s Intersectem, to ale není ještě úplný průšvih. Problémy začínají tehdy, kdy začne fungovat virus, který je v Intersectu nahraný.
